Deprem konutları ihalelerinin belli firmalara verilmesi yönündeki iddialarla ilgili olarak da açıklamalarda bulunan Aydın, depremden sonra işin aciliyeti nedeniyle Bakanlar Kurulu kararı ile inanılmaz yetkilerle donatıldığını söyledi. O dönemde baba dostu olan eski bir Milletvekilinin kendisini ziyaret ettiğini ve bu Milletvekilinin ziyareti sırasında kendisine ''Seni padişah yetkisi ile donatmışlar. Bu ülkede şartlar çabuk değişir. Yetkilerini ona göre kullan, sonrada seni suçlarlar'' diye uyarıda bulunduğunu söyledi. Aydın, ''Bu sözleri kulağıma küpe yaptım ve gerekmediği zaman bu yetkimi kullanmadım'' dedi.Deprem bölgesine 600 milyon dolarlık iş yaptıklarını belirten Aydın, Meclis Soruşturma Komisyonu'nun bunlarla ilgili tek satır iddia da bulunamadığını söyledi. Komisyonun, kendisi hakkında siyasi hasımlık üzerine suçlamalarda bulunduğunu kaydeden Aydın, ''Komisyon tamamen siyasi davranmıştır. Aldıkları emri yerine getirmek için militanca davranmıştır'' dedi. Komisyonda ifade verirken savunmasının kısıtlandığını söyleyen Koray Aydın, ''İfade verirken AK Parti Milletvekillerini şiddetine, ağır baskısına maruz kaldım. Bana laf attılar, hatta mikrofonumun sesinin kıstılar. Bu nedenle Yüce Divan Heyeti'nden dosyamın Meclis'e geri iadesini istiyorum'' şeklinde konuştu. Aydın, 3628 sayılı Mal Bildiriminde Bulunulması, Rüşvet ve Yolsuzluklarla Mücadele Kanunu'nun 13. maddesine muhalefet ettiği yönündeki iddialara ilgili ise şunları söyledi: ''Soruşturma Komisyonu benim 1995-199 yılları arasında yani vatandaş Koray Aydın olduğum dönemdeki mal varlığım ile ilgili suçlamalarda bulunuldu. Bu Anayasa'ya, yasalara aykırıdır. Hiçbir sade vatandaşın mal bildirimde bulunması zorunluluğu yoktur.'' ''Bakanlığım dönemindeki mal varlığı ile ilgili her türlü hesabı veririm'' diyen Aydın, mal varlığı ile ilgili kaynakların hepsinin belli olduğunu söyledi. 1992 yılındaki mal bildiriminde 26 kalem, 2000 yılındaki 26 kalemin mal bildiriminde yer aldığını belirten Aydın, 2002 yılındaki mal varlığındaki artışın ise maaş, kira, faiz, ticaretle uğraşan babasının torunlarına sağladığı maddi destek olarak gösterdi. Mahkeme, Aydın'ın eniştesi Ali Çağlayan kız kardeşi Arzu Çağlayan'ın da aralarında bulunduğu 10 tanığa davetiye çıkarılmasına karar vererek duruşmayı 26 Nisan 2005 tarihine erteledi. Yüce Divan, Yargıtay Cumhuriyet Başsavcısı Nuri Ok'un istemi üzerine, Koray Aydın'ın, eşinin ve çocuklarının 2 milyon 320 bin dolar ve 2 milyon 317 bin Euro değerindeki döviz, para, taşınır veya taşınmaz mallarına tedbir koymuştu.