İYİ Partililer, ikinci tur cumhurbaşkanlığı seçimlerini gergin takip etti. Partinin genel merkezinde sessizlik hakimdi. İlk tur seçimleri öncesinde genel merkez önüne kutlamalar için kurulan dev ekranın ikinci tur seçimleri öncesi kurulmaması dikkat çekti.
Cumhuriyet'ten Merve Kılıç'ın haberine göre sandıkların yüzde 92’sinin açılması ve Erdoğan’ın yarışı önde götürmesi üzerine partililer arasında “yanlış aday” polemiği başladı. Partililer, Ekrem İmamoğlu ve Mansur Yavaş’ın adaylığı durumunda seçimin kazanılacağını belirtti. Öte yandan partide “Akşener haklıydı” söylemi hakimdi.
İYİ Parti ve CHP milletvekili seçimlerinde 16 ilde fermuar sistemi uygulamış ve CHP, İYİ Parti lehine Gümüşhane, Bitlis, Aksaray, Yozgat, Bayburt, Muş ve Çankırı illerinde aday çıkarmamıştı. İYİ Parti’nin milletvekili seçimlerinde yüksek oy aldığı bu iller, cumhurbaşkanlığı ikinci tur seçimlerinde “Erdoğan” dedi. İYİ Parti’nin ilk kez milletvekili çıkardığı Yozgat’ta Erdoğan yüzde 76,36 oranında oy alırken Kılıçdaroğlu yüzde 23, 64 oy aldı.