ESKİ Genelkurmay Başkanı emekli Org. İlker Başbuğ, YAŞ kararıyla emekli edilen general ve amirallerden birçoğunu yakinen tanıdığını belirterek, 'Hem onlar adına hem de Türk ordusu adına bu sonuçtan dolayı büyük üzüntü duyduğumu belirtmek isterim' dedi.
Başbuğ, CNN Türk'te Şirin Payzın'ın sunduğu 360 Derece programında avukatı İlkay Sezer aracılığıyla çarpıcı açıklamalar yaptı.  Başbakan Erdoğan'a tutuklanmasına ilişkin değerlendirmeleri için teşekkür eden Başbuğ isyanını dile getirdi:
- Ben ve yaşıtlarım yaşamımızın son çeyreği içerisindeyiz. Hayatınızın neredeyse son 20 yılını terörle mücadele içinde geçirmişsiniz. Sonra birileri kalkıyor size terörist terör örgütü yöneticisi diyor, kanınız donuyor. İsyan ediyorsunuz bu sizi manen öldürüyor: Bu suçlama kişisel olarak kalıyor mu hayır. TSK'da terör örgütü gösteriliyor, bu suçlama aslında siyaseten devlete de yöneltilmiş oluyor.
- TSK zor bir dönemden geçiyor YAŞ kararıyla 37 general ve amiralin emekli edildiğini öğrendim. Birçoğunu yakinen tanımaktayım. Onların uzun süre TSK'ya hizmet verebileceğine inanmaktaydım. Hem onlar adına hem de Türk ordusu adına bu sonuçtan dolayı büyük üzüntü duyduğumu belirtmek isterim.
-  Ordu terörle mücadeleyi yasal çerçevede ve sivil halka zarar vermeden yürütmeye çalışıyor. Elbette bu doğrudur.  Burada altı çizilmesi gereken asıl nokta, siz bu mücadeleyi yasal çerçevede yürütmenize rağmen bir gün gizli tanık ifadeleriyle suçlanabilme durumunuzun olmasıdır. Personel kendini güvenli hissetmelidir. Irak'ın kuzeyindeki PKK terör örgütünün kullandığı güvenli bölge ortadan kaldırılmalıdır. İkinci önemli husus ise dağdan inişleri teşvik edilmelidir.
-  Aziz milletim  senin evlatlarından oluşan  Türk ordusu bir terör örgütü olarak gösteriliyor.  Bu ileri sürülen çirkin iddia vicdanınızı hiç rahatsız etmiyor mu içinde bulunduğumuz süreçte yurtiçinde ve yurtdışındaki bizi sevenlerin ne kadar çok olduğunu öğrendim. Bizim için en büyük destek ve moral kaynağı oldu ve olmaya da devam ediyor.
-  TBMM'ye sunulan tezkerenin  1 Mart 2003'te TBMM'de kabul edilmesi için gerekli olan oyun sağlanamaması ile Türkiye PKK terör örgütünü marjinalize edebileceği fırsatı bir defa daha kaçırmıştır.