YÖK'ün yeni Başkanı Prof. Y. Ziya Özcan “Yetkilerini kullanma” deyince Başkanvekili Prof. İsa Eşme izne ayrıldı. Diğer Başkanvekili Prof. Aybar Ertepınar da 9 Aralık'ta istifa etmişti. Böylece YÖK Başkanvekilsiz kaldı.

YÖK Başkanvekili Prof. Dr. İsa Eşme, 28 Aralık Cuma gününden itibaren, ilk YÖK Genel Kurul toplantısına kadar izne ayrılacak.
 
Prof. Dr. Eşme, yaptığı yazılı açıklamada, 15 Ağustos 2005 tarihinde YÖK Genel Kurulu tarafından YÖK Başkanvekilliğine seçimle getirildiğini, görevini 2.5 yıldan bu yana sürdürdüğünü anımsattı.

YÖK Başkanvekili Prof. Dr. Eşme, açıklamasında şunları kaydetti:

''Yeni Başkan Sayın Yusuf Ziya Özcan'ın 25 Aralık 2007 günü saat 14.00'den itibaren YÖK Başkanvekilliği yetkilerimi kullanmamam hususundaki isteği nedeniyle 28 Aralık 2007'den yapılacak ilk YÖK Genel Kurulu toplantısına kadar izinli sayılmamı içeren dilekçemi Başkanlığa sunmuş bulunmaktayım.''

Yeni başkanvekilini Genel Kurul belirleyecek 
 İzne ayrıldığını açıklayan Prof. Dr. İsa Eşme'nin görevinden ayrılması halinde yeni başkanvekilini YÖK Genel Kurulu belirleyecek.

2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu'na göre, iki başkanvekilinden birini YÖK Başkanı doğrudan kendisi atıyor. Diğer başkanvekilini ise YÖK Genel Kurulu seçiyor. Eşme'yi, YÖK Genel Kurulu başkanvekili olarak belirlemişti.

Prof. Dr. Yusuf Ziya Özcan, YÖK Başkanlığı'na atandığında hem başkanvekilliği görevinden hem de YÖK üyeliğinden istifa eden Prof. Dr. Aybar Ertepınar'ı ise dönemin YÖK Başkanı Prof. Dr. Erdoğan Teziç başkanvekilliğine getirmişti. Ertepınar'ın istifasının ardından henüz bir atama yapılmadı.

Bu arada YÖK Genel Kurulu toplantısının 2008 Ocak ayının sonuna doğru yapılması bekleniyor.

Öte yandan, Cumhurbaşkanlığı kontenjanından YÖK üyeliğine atanan Prof. Dr. Ergin Nami Nomer ile Prof. Dr. İlhan Tekeli'nin görev süresi 16 Ocak 2008'de sona erecek.